第１回受賞者（第１５回生体機能関連化学シンポジウム、奈良女子大理学部、２０００年９月２３日、２４日）
浅沼浩之（東大先端研）
「核酸機能の光制御を目指した修飾オリゴヌクレオチドの設計（１６）アゾベンゼン導入DNAによる二重鎖形成の光制御機構の解析」
井原敏博（熊大工）
「金属配位基を導入したDNAコンジュゲートによる協同的三本鎖」
江原靖人（神戸大発達科学）
「一本鎖DNA上での人工ペプチド合成系の構築」
津本浩平（東北大院工）
「抗体の標的部位指向性機能変換と相互作用の精密解析」
第２回受賞者（第１６回生体機能関連化学シンポジウム、千葉大学西千葉キャンパス、２００１年９月２０日、２１日）
菊地和也（東大院薬）
「新規亜鉛イオン蛍光センサー分子のデザイン・合成と生細胞可視化解析」
竹内正之（九大院工）
「アロステリズムを利用した非線形応答を示す分子認識系の構築」
林 高史（九大院工・さきがけ２１）
「ヘムプロピオン酸側鎖修飾を駆使したミオグロビンの機能変換」
和田健彦（阪大院工）
「ガン細胞特異的に機能を発現する次世代アンチセンス分子の創製」
第３回受賞者（第１７回生体機能関連化学シンポジウム、大阪大学豊中キャンパス、２００２年９月２５日、２６日）
田中 健太郎（東大院理）
「金属錯体型DNAを用いた金属イオンのナノ集積化」
谷 文都（九大有機研）
「グロビンモデルとしての双冠型鉄ポルフィリンにおける静電的効果によるCO2, O2の識別」
長崎 健（阪市大院工）
「光開裂性カチオン脂質を用いた高効率遺伝子デリバリー」
松浦 和則（九大院工）
「オリゴヌクレオチドの自己組織化による“Nucleo-nanocages”の創成」
第４回受賞者（第１８回生体機能関連化学シンポジウム、熊本大学工学部、２００３年１０月１２日、１３日）バイオテクノロジー部会と合同でシンポジウムを開催した。
生体機能関連化学部会関係
上野 隆史（名大物国セ）
「蛋白質―蛋白質複合化を利用した金属化合物の機能制御」
岡本 晃充（京大院工）
「塩基識別型蛍光性核酸塩基を含むフルオレセインラベルされた核酸プローブによる一塩基多型検出法」
木村 太郎（福岡県工技センター生食研）
「多糖シゾフィランを用いた新規メッセンジャーRNA分離システム」
中村 史（産総研）
「エッチングにより先鋭化されたAFM探針による細胞操作」
バイオテクノロジー部会関係
依馬 正（岡山大工）
「酵素を利用したキラリティー検出とオートクレーブ中における120℃までの高温生体触媒反応」
一二三 恵美（広島県大生物資源）
「Helicobacter pylori ureaseに対する天然型抗体酵素の特徴」
第５回受賞者（第１９回生体機能関連化学シンポジウム、東京大学弥生講堂ほか、２００４年１０月８日、９日）
王子田 彰夫（九大院・工）
「人工レセプターによるリン酸化タンパク質・ペプチドの特異的認識」
小川 和也（奈良先端大院・物質）
「アセチレン結合で連結した超分子ポルフィリンによる二光子光線力学療法」
野島 高彦（九大院・工）
「ペプチド-DNAコンジュゲートを利用したペプチド-蛋白質相互作用検出」
古澤 宏幸（東工大院・生命理工）
「水晶発振子を用いたユビキチン-プロテアソーム系タンパク質転移反応の観察」
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